Protein–RNA interactions for Protein: P14314

PRKCSH, Glucosidase 2 subunit beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCSHP14314 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKCSHP14314 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKCSHP14314 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKCSHP14314 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKCSHP14314 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKCSHP14314 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKCSHP14314 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKCSHP14314 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKCSHP14314 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKCSHP14314 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKCSHP14314 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKCSHP14314 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKCSHP14314 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKCSHP14314 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKCSHP14314 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKCSHP14314 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKCSHP14314 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKCSHP14314 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKCSHP14314 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKCSHP14314 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKCSHP14314 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKCSHP14314 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKCSHP14314 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKCSHP14314 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKCSHP14314 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKCSHP14314 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKCSHP14314 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKCSHP14314 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKCSHP14314 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKCSHP14314 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKCSHP14314 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKCSHP14314 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKCSHP14314 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKCSHP14314 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKCSHP14314 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKCSHP14314 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKCSHP14314 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKCSHP14314 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKCSHP14314 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKCSHP14314 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKCSHP14314 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKCSHP14314 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKCSHP14314 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKCSHP14314 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKCSHP14314 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKCSHP14314 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKCSHP14314 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKCSHP14314 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKCSHP14314 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKCSHP14314 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKCSHP14314 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKCSHP14314 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms