Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-DOBP13765 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HLA-DOBP13765 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-DOBP13765 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-DOBP13765 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-DOBP13765 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-DOBP13765 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-DOBP13765 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-DOBP13765 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-DOBP13765 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLA-DOBP13765 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLA-DOBP13765 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLA-DOBP13765 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLA-DOBP13765 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLA-DOBP13765 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLA-DOBP13765 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLA-DOBP13765 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-DOBP13765 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-DOBP13765 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-DOBP13765 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-DOBP13765 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-DOBP13765 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-DOBP13765 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-DOBP13765 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-DOBP13765 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-DOBP13765 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-DOBP13765 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-DOBP13765 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-DOBP13765 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-DOBP13765 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-DOBP13765 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-DOBP13765 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-DOBP13765 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-DOBP13765 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-DOBP13765 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-DOBP13765 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-DOBP13765 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-DOBP13765 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-DOBP13765 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-DOBP13765 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-DOBP13765 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-DOBP13765 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-DOBP13765 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-DOBP13765 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-DOBP13765 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-DOBP13765 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms