Protein–RNA interactions for Protein: P13688

CEACAM1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM1P13688 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CEACAM1P13688 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CEACAM1P13688 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEACAM1P13688 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEACAM1P13688 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEACAM1P13688 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEACAM1P13688 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEACAM1P13688 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CEACAM1P13688 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEACAM1P13688 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEACAM1P13688 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEACAM1P13688 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEACAM1P13688 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEACAM1P13688 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEACAM1P13688 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEACAM1P13688 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEACAM1P13688 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEACAM1P13688 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CEACAM1P13688 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEACAM1P13688 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEACAM1P13688 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEACAM1P13688 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEACAM1P13688 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEACAM1P13688 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEACAM1P13688 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEACAM1P13688 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEACAM1P13688 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEACAM1P13688 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEACAM1P13688 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEACAM1P13688 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEACAM1P13688 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEACAM1P13688 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEACAM1P13688 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CEACAM1P13688 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEACAM1P13688 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEACAM1P13688 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEACAM1P13688 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEACAM1P13688 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CEACAM1P13688 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEACAM1P13688 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEACAM1P13688 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEACAM1P13688 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEACAM1P13688 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEACAM1P13688 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEACAM1P13688 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms