Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RARGP13631 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RARGP13631 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RARGP13631 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RARGP13631 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RARGP13631 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RARGP13631 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RARGP13631 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RARGP13631 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RARGP13631 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RARGP13631 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RARGP13631 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RARGP13631 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RARGP13631 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RARGP13631 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RARGP13631 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RARGP13631 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RARGP13631 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RARGP13631 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RARGP13631 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RARGP13631 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RARGP13631 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RARGP13631 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RARGP13631 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RARGP13631 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RARGP13631 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RARGP13631 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RARGP13631 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RARGP13631 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RARGP13631 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RARGP13631 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RARGP13631 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RARGP13631 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RARGP13631 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RARGP13631 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RARGP13631 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RARGP13631 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RARGP13631 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RARGP13631 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RARGP13631 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RARGP13631 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RARGP13631 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RARGP13631 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RARGP13631 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RARGP13631 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RARGP13631 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RARGP13631 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RARGP13631 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RARGP13631 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RARGP13631 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RARGP13631 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RARGP13631 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RARGP13631 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RARGP13631 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RARGP13631 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RARGP13631 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RARGP13631 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RARGP13631 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RARGP13631 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RARGP13631 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RARGP13631 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RARGP13631 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RARGP13631 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RARGP13631 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RARGP13631 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RARGP13631 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RARGP13631 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RARGP13631 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RARGP13631 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RARGP13631 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RARGP13631 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RARGP13631 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RARGP13631 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RARGP13631 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RARGP13631 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RARGP13631 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RARGP13631 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RARGP13631 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RARGP13631 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RARGP13631 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RARGP13631 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RARGP13631 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RARGP13631 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RARGP13631 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RARGP13631 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RARGP13631 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RARGP13631 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RARGP13631 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RARGP13631 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RARGP13631 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RARGP13631 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RARGP13631 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RARGP13631 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RARGP13631 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RARGP13631 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RARGP13631 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RARGP13631 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RARGP13631 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RARGP13631 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RARGP13631 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms