Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXD8P13378 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXD8P13378 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXD8P13378 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXD8P13378 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXD8P13378 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXD8P13378 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXD8P13378 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXD8P13378 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXD8P13378 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXD8P13378 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXD8P13378 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXD8P13378 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXD8P13378 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXD8P13378 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXD8P13378 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXD8P13378 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HOXD8P13378 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXD8P13378 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXD8P13378 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXD8P13378 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXD8P13378 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXD8P13378 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXD8P13378 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXD8P13378 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXD8P13378 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXD8P13378 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXD8P13378 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXD8P13378 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXD8P13378 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXD8P13378 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXD8P13378 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXD8P13378 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXD8P13378 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXD8P13378 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXD8P13378 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXD8P13378 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXD8P13378 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXD8P13378 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXD8P13378 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXD8P13378 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXD8P13378 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXD8P13378 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXD8P13378 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXD8P13378 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXD8P13378 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXD8P13378 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXD8P13378 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXD8P13378 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXD8P13378 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXD8P13378 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXD8P13378 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXD8P13378 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXD8P13378 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXD8P13378 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXD8P13378 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXD8P13378 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXD8P13378 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXD8P13378 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXD8P13378 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXD8P13378 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXD8P13378 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXD8P13378 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXD8P13378 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXD8P13378 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXD8P13378 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXD8P13378 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXD8P13378 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXD8P13378 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXD8P13378 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXD8P13378 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXD8P13378 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXD8P13378 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXD8P13378 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXD8P13378 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXD8P13378 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXD8P13378 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXD8P13378 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXD8P13378 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXD8P13378 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXD8P13378 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXD8P13378 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXD8P13378 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXD8P13378 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXD8P13378 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXD8P13378 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXD8P13378 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXD8P13378 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXD8P13378 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXD8P13378 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXD8P13378 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXD8P13378 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXD8P13378 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXD8P13378 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXD8P13378 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HOXD8P13378 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXD8P13378 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXD8P13378 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXD8P13378 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXD8P13378 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms