Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LYL1P12980 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LYL1P12980 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LYL1P12980 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LYL1P12980 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LYL1P12980 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LYL1P12980 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LYL1P12980 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LYL1P12980 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LYL1P12980 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LYL1P12980 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LYL1P12980 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LYL1P12980 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LYL1P12980 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LYL1P12980 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LYL1P12980 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LYL1P12980 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LYL1P12980 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LYL1P12980 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LYL1P12980 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LYL1P12980 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LYL1P12980 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LYL1P12980 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LYL1P12980 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LYL1P12980 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LYL1P12980 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LYL1P12980 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LYL1P12980 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LYL1P12980 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LYL1P12980 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LYL1P12980 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LYL1P12980 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LYL1P12980 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LYL1P12980 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LYL1P12980 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LYL1P12980 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LYL1P12980 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LYL1P12980 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LYL1P12980 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LYL1P12980 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LYL1P12980 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LYL1P12980 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LYL1P12980 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LYL1P12980 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LYL1P12980 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LYL1P12980 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
LYL1P12980 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LYL1P12980 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LYL1P12980 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LYL1P12980 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LYL1P12980 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LYL1P12980 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LYL1P12980 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LYL1P12980 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LYL1P12980 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LYL1P12980 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LYL1P12980 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LYL1P12980 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LYL1P12980 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LYL1P12980 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LYL1P12980 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LYL1P12980 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LYL1P12980 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LYL1P12980 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LYL1P12980 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LYL1P12980 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LYL1P12980 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LYL1P12980 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LYL1P12980 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LYL1P12980 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LYL1P12980 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LYL1P12980 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LYL1P12980 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LYL1P12980 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LYL1P12980 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LYL1P12980 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LYL1P12980 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LYL1P12980 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LYL1P12980 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LYL1P12980 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LYL1P12980 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LYL1P12980 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LYL1P12980 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LYL1P12980 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LYL1P12980 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LYL1P12980 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LYL1P12980 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LYL1P12980 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LYL1P12980 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LYL1P12980 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LYL1P12980 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LYL1P12980 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LYL1P12980 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LYL1P12980 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LYL1P12980 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LYL1P12980 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LYL1P12980 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LYL1P12980 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LYL1P12980 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LYL1P12980 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms