Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ESRRAP11474 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms