Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
TOP2AP11388 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
TOP2AP11388 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
TOP2AP11388 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
TOP2AP11388 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
TOP2AP11388 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
TOP2AP11388 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
TOP2AP11388 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
TOP2AP11388 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
TOP2AP11388 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
TOP2AP11388 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
TOP2AP11388 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
TOP2AP11388 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
TOP2AP11388 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
TOP2AP11388 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
TOP2AP11388 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
TOP2AP11388 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
TOP2AP11388 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
TOP2AP11388 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
TOP2AP11388 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
TOP2AP11388 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC41.39■■■■■ 4.22
TOP2AP11388 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
TOP2AP11388 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.21
TOP2AP11388 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.21
TOP2AP11388 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
TOP2AP11388 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
TOP2AP11388 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
TOP2AP11388 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
TOP2AP11388 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
TOP2AP11388 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
TOP2AP11388 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
TOP2AP11388 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC41.35■■■■■ 4.21
TOP2AP11388 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
TOP2AP11388 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
TOP2AP11388 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
TOP2AP11388 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
TOP2AP11388 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
TOP2AP11388 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
TOP2AP11388 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
TOP2AP11388 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
TOP2AP11388 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
TOP2AP11388 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
TOP2AP11388 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.2
TOP2AP11388 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
TOP2AP11388 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
TOP2AP11388 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
TOP2AP11388 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
TOP2AP11388 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.31■■■■■ 4.2
TOP2AP11388 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
TOP2AP11388 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
TOP2AP11388 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
TOP2AP11388 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC41.3■■■■■ 4.2
TOP2AP11388 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
TOP2AP11388 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
TOP2AP11388 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
TOP2AP11388 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
TOP2AP11388 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
TOP2AP11388 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
TOP2AP11388 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
TOP2AP11388 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC41.28■■■■■ 4.2
TOP2AP11388 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
TOP2AP11388 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC41.28■■■■■ 4.2
TOP2AP11388 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
TOP2AP11388 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
TOP2AP11388 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
TOP2AP11388 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
TOP2AP11388 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC41.28■■■■■ 4.2
TOP2AP11388 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
TOP2AP11388 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
TOP2AP11388 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
TOP2AP11388 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
TOP2AP11388 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.2
TOP2AP11388 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.19
TOP2AP11388 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC41.25■■■■■ 4.19
TOP2AP11388 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
TOP2AP11388 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
TOP2AP11388 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
TOP2AP11388 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
TOP2AP11388 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
TOP2AP11388 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC41.24■■■■■ 4.19
TOP2AP11388 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
TOP2AP11388 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
TOP2AP11388 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
TOP2AP11388 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
TOP2AP11388 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
TOP2AP11388 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
TOP2AP11388 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
TOP2AP11388 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
TOP2AP11388 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
TOP2AP11388 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
TOP2AP11388 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
TOP2AP11388 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
TOP2AP11388 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC41.22■■■■■ 4.19
TOP2AP11388 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
TOP2AP11388 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
TOP2AP11388 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC41.21■■■■■ 4.19
TOP2AP11388 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
TOP2AP11388 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
TOP2AP11388 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
TOP2AP11388 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.2■■■■■ 4.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms