Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRFP10586 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRFP10586 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRFP10586 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRFP10586 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRFP10586 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRFP10586 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRFP10586 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRFP10586 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRFP10586 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRFP10586 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRFP10586 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRFP10586 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRFP10586 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRFP10586 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRFP10586 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRFP10586 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRFP10586 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRFP10586 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRFP10586 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRFP10586 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRFP10586 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRFP10586 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRFP10586 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRFP10586 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRFP10586 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRFP10586 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRFP10586 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRFP10586 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRFP10586 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRFP10586 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRFP10586 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRFP10586 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRFP10586 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRFP10586 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRFP10586 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRFP10586 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRFP10586 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRFP10586 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRFP10586 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRFP10586 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
PTPRFP10586 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRFP10586 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRFP10586 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRFP10586 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRFP10586 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRFP10586 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRFP10586 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRFP10586 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRFP10586 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRFP10586 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRFP10586 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRFP10586 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRFP10586 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRFP10586 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRFP10586 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRFP10586 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRFP10586 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRFP10586 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRFP10586 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRFP10586 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRFP10586 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRFP10586 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRFP10586 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRFP10586 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRFP10586 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRFP10586 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRFP10586 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRFP10586 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRFP10586 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRFP10586 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRFP10586 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRFP10586 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRFP10586 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRFP10586 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRFP10586 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRFP10586 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRFP10586 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRFP10586 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRFP10586 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRFP10586 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRFP10586 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRFP10586 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PTPRFP10586 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRFP10586 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRFP10586 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRFP10586 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRFP10586 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRFP10586 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRFP10586 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRFP10586 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRFP10586 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRFP10586 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRFP10586 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRFP10586 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRFP10586 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRFP10586 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRFP10586 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRFP10586 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRFP10586 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms