Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM6P0DI80 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM6P0DI80 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM6P0DI80 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM6P0DI80 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM6P0DI80 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM6P0DI80 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM6P0DI80 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM6P0DI80 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM6P0DI80 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM6P0DI80 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM6P0DI80 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms