Protein–RNA interactions for Protein: P0CI25

TRIM49, Tripartite motif-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49P0CI25 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM49P0CI25 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM49P0CI25 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM49P0CI25 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM49P0CI25 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM49P0CI25 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM49P0CI25 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM49P0CI25 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM49P0CI25 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM49P0CI25 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM49P0CI25 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM49P0CI25 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM49P0CI25 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIM49P0CI25 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM49P0CI25 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM49P0CI25 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM49P0CI25 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM49P0CI25 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM49P0CI25 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM49P0CI25 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM49P0CI25 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM49P0CI25 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM49P0CI25 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM49P0CI25 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM49P0CI25 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM49P0CI25 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM49P0CI25 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM49P0CI25 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM49P0CI25 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM49P0CI25 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM49P0CI25 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM49P0CI25 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM49P0CI25 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM49P0CI25 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM49P0CI25 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM49P0CI25 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM49P0CI25 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM49P0CI25 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM49P0CI25 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM49P0CI25 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM49P0CI25 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM49P0CI25 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM49P0CI25 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM49P0CI25 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM49P0CI25 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM49P0CI25 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM49P0CI25 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM49P0CI25 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM49P0CI25 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM49P0CI25 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM49P0CI25 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM49P0CI25 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM49P0CI25 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms