Protein–RNA interactions for Protein: P0CG47

UBB, Polyubiquitin-B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBBP0CG47 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBBP0CG47 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
UBBP0CG47 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms