Protein–RNA interactions for Protein: P09619

PDGFRB, Platelet-derived growth factor receptor beta, humanhuman

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Length 1,106 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRBP09619 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDGFRBP09619 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDGFRBP09619 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDGFRBP09619 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDGFRBP09619 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDGFRBP09619 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDGFRBP09619 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDGFRBP09619 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDGFRBP09619 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDGFRBP09619 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDGFRBP09619 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDGFRBP09619 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDGFRBP09619 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDGFRBP09619 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDGFRBP09619 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDGFRBP09619 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDGFRBP09619 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDGFRBP09619 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDGFRBP09619 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDGFRBP09619 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDGFRBP09619 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDGFRBP09619 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDGFRBP09619 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDGFRBP09619 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PDGFRBP09619 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PDGFRBP09619 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDGFRBP09619 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PDGFRBP09619 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDGFRBP09619 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDGFRBP09619 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
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