Protein–RNA interactions for Protein: P08865

RPSA, 40S ribosomal protein SA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP08865 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPSAP08865 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPSAP08865 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPSAP08865 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPSAP08865 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPSAP08865 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPSAP08865 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPSAP08865 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPSAP08865 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPSAP08865 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RPSAP08865 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPSAP08865 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPSAP08865 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPSAP08865 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPSAP08865 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPSAP08865 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPSAP08865 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPSAP08865 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPSAP08865 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPSAP08865 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPSAP08865 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPSAP08865 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPSAP08865 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPSAP08865 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPSAP08865 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPSAP08865 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPSAP08865 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPSAP08865 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RPSAP08865 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RPSAP08865 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPSAP08865 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPSAP08865 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPSAP08865 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPSAP08865 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPSAP08865 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPSAP08865 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPSAP08865 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPSAP08865 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPSAP08865 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPSAP08865 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPSAP08865 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPSAP08865 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPSAP08865 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPSAP08865 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPSAP08865 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPSAP08865 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPSAP08865 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPSAP08865 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPSAP08865 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPSAP08865 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPSAP08865 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPSAP08865 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPSAP08865 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPSAP08865 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RPSAP08865 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPSAP08865 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPSAP08865 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPSAP08865 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPSAP08865 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPSAP08865 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPSAP08865 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPSAP08865 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPSAP08865 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPSAP08865 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPSAP08865 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPSAP08865 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPSAP08865 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPSAP08865 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPSAP08865 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPSAP08865 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPSAP08865 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPSAP08865 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPSAP08865 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPSAP08865 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RPSAP08865 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPSAP08865 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPSAP08865 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPSAP08865 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPSAP08865 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPSAP08865 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPSAP08865 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPSAP08865 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPSAP08865 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPSAP08865 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPSAP08865 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPSAP08865 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPSAP08865 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPSAP08865 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPSAP08865 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPSAP08865 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPSAP08865 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPSAP08865 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPSAP08865 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPSAP08865 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPSAP08865 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPSAP08865 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPSAP08865 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RPSAP08865 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPSAP08865 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPSAP08865 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms