Protein–RNA interactions for Protein: P07384

CAPN1, Calpain-1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN1P07384 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CAPN1P07384 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN1P07384 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms