Protein–RNA interactions for Protein: P07358

C8B, Complement component C8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8BP07358 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8BP07358 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8BP07358 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8BP07358 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8BP07358 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8BP07358 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8BP07358 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8BP07358 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8BP07358 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8BP07358 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8BP07358 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8BP07358 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8BP07358 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8BP07358 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C8BP07358 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8BP07358 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8BP07358 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8BP07358 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8BP07358 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8BP07358 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8BP07358 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8BP07358 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8BP07358 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8BP07358 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8BP07358 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C8BP07358 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C8BP07358 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8BP07358 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8BP07358 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8BP07358 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8BP07358 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8BP07358 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8BP07358 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8BP07358 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8BP07358 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8BP07358 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8BP07358 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8BP07358 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8BP07358 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8BP07358 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8BP07358 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C8BP07358 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8BP07358 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8BP07358 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8BP07358 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8BP07358 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8BP07358 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8BP07358 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8BP07358 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8BP07358 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C8BP07358 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C8BP07358 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C8BP07358 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
C8BP07358 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8BP07358 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8BP07358 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8BP07358 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8BP07358 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8BP07358 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C8BP07358 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8BP07358 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8BP07358 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8BP07358 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C8BP07358 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C8BP07358 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C8BP07358 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C8BP07358 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C8BP07358 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C8BP07358 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C8BP07358 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C8BP07358 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C8BP07358 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C8BP07358 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C8BP07358 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C8BP07358 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C8BP07358 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C8BP07358 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C8BP07358 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C8BP07358 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8BP07358 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8BP07358 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C8BP07358 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8BP07358 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8BP07358 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8BP07358 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8BP07358 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8BP07358 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8BP07358 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C8BP07358 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C8BP07358 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C8BP07358 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C8BP07358 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C8BP07358 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C8BP07358 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C8BP07358 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C8BP07358 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C8BP07358 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C8BP07358 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C8BP07358 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C8BP07358 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms