Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTMAP06454 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTMAP06454 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTMAP06454 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTMAP06454 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTMAP06454 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTMAP06454 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PTMAP06454 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTMAP06454 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTMAP06454 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTMAP06454 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTMAP06454 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTMAP06454 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PTMAP06454 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTMAP06454 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTMAP06454 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTMAP06454 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTMAP06454 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTMAP06454 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTMAP06454 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTMAP06454 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTMAP06454 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTMAP06454 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTMAP06454 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTMAP06454 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTMAP06454 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTMAP06454 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTMAP06454 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTMAP06454 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTMAP06454 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTMAP06454 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTMAP06454 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTMAP06454 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTMAP06454 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTMAP06454 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTMAP06454 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTMAP06454 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTMAP06454 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTMAP06454 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTMAP06454 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTMAP06454 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTMAP06454 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTMAP06454 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTMAP06454 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTMAP06454 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTMAP06454 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTMAP06454 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTMAP06454 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTMAP06454 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
PTMAP06454 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
PTMAP06454 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTMAP06454 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTMAP06454 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTMAP06454 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTMAP06454 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTMAP06454 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTMAP06454 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTMAP06454 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTMAP06454 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTMAP06454 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTMAP06454 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTMAP06454 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTMAP06454 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PTMAP06454 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTMAP06454 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTMAP06454 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTMAP06454 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTMAP06454 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTMAP06454 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTMAP06454 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTMAP06454 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTMAP06454 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTMAP06454 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTMAP06454 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTMAP06454 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTMAP06454 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTMAP06454 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTMAP06454 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTMAP06454 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTMAP06454 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTMAP06454 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTMAP06454 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTMAP06454 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTMAP06454 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTMAP06454 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTMAP06454 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTMAP06454 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTMAP06454 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTMAP06454 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTMAP06454 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTMAP06454 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTMAP06454 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTMAP06454 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTMAP06454 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTMAP06454 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTMAP06454 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTMAP06454 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTMAP06454 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTMAP06454 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTMAP06454 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms