Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR3DP05423 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR3DP05423 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR3DP05423 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR3DP05423 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR3DP05423 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR3DP05423 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR3DP05423 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR3DP05423 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR3DP05423 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
POLR3DP05423 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
POLR3DP05423 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLR3DP05423 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLR3DP05423 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLR3DP05423 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
POLR3DP05423 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLR3DP05423 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLR3DP05423 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLR3DP05423 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLR3DP05423 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLR3DP05423 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLR3DP05423 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR3DP05423 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR3DP05423 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR3DP05423 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR3DP05423 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR3DP05423 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR3DP05423 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR3DP05423 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR3DP05423 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR3DP05423 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR3DP05423 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR3DP05423 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR3DP05423 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR3DP05423 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR3DP05423 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR3DP05423 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR3DP05423 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR3DP05423 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR3DP05423 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR3DP05423 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR3DP05423 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR3DP05423 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR3DP05423 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR3DP05423 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR3DP05423 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR3DP05423 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR3DP05423 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR3DP05423 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR3DP05423 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR3DP05423 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR3DP05423 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR3DP05423 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR3DP05423 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
POLR3DP05423 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
POLR3DP05423 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLR3DP05423 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLR3DP05423 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLR3DP05423 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLR3DP05423 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLR3DP05423 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR3DP05423 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR3DP05423 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR3DP05423 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR3DP05423 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR3DP05423 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR3DP05423 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR3DP05423 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR3DP05423 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR3DP05423 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR3DP05423 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR3DP05423 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR3DP05423 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR3DP05423 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR3DP05423 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR3DP05423 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR3DP05423 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR3DP05423 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR3DP05423 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR3DP05423 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR3DP05423 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR3DP05423 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR3DP05423 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR3DP05423 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR3DP05423 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR3DP05423 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR3DP05423 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR3DP05423 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR3DP05423 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR3DP05423 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR3DP05423 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR3DP05423 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR3DP05423 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLR3DP05423 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLR3DP05423 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLR3DP05423 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms