Protein–RNA interactions for Protein: P04279

SEMG1, Semenogelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMG1P04279 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SEMG1P04279 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms