Protein–RNA interactions for Protein: P02708

CHRNA1, Acetylcholine receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA1P02708 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRNA1P02708 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRNA1P02708 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRNA1P02708 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHRNA1P02708 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHRNA1P02708 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHRNA1P02708 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNA1P02708 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNA1P02708 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNA1P02708 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNA1P02708 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNA1P02708 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNA1P02708 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNA1P02708 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNA1P02708 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNA1P02708 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNA1P02708 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNA1P02708 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNA1P02708 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNA1P02708 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNA1P02708 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNA1P02708 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNA1P02708 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNA1P02708 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNA1P02708 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNA1P02708 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNA1P02708 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNA1P02708 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNA1P02708 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNA1P02708 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNA1P02708 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNA1P02708 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRNA1P02708 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRNA1P02708 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRNA1P02708 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNA1P02708 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNA1P02708 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNA1P02708 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNA1P02708 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA1P02708 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA1P02708 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA1P02708 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA1P02708 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA1P02708 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNA1P02708 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNA1P02708 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNA1P02708 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNA1P02708 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNA1P02708 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNA1P02708 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNA1P02708 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNA1P02708 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNA1P02708 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNA1P02708 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNA1P02708 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNA1P02708 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNA1P02708 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNA1P02708 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNA1P02708 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNA1P02708 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNA1P02708 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNA1P02708 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNA1P02708 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CHRNA1P02708 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNA1P02708 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNA1P02708 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNA1P02708 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNA1P02708 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNA1P02708 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNA1P02708 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNA1P02708 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNA1P02708 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNA1P02708 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNA1P02708 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNA1P02708 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNA1P02708 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNA1P02708 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNA1P02708 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNA1P02708 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNA1P02708 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNA1P02708 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNA1P02708 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNA1P02708 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNA1P02708 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNA1P02708 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNA1P02708 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNA1P02708 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNA1P02708 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNA1P02708 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNA1P02708 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNA1P02708 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNA1P02708 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNA1P02708 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNA1P02708 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNA1P02708 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNA1P02708 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNA1P02708 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNA1P02708 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNA1P02708 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNA1P02708 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms