Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGAP02671 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FGAP02671 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FGAP02671 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
FGAP02671 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FGAP02671 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FGAP02671 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGAP02671 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGAP02671 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGAP02671 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGAP02671 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGAP02671 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGAP02671 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGAP02671 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGAP02671 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FGAP02671 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FGAP02671 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FGAP02671 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FGAP02671 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FGAP02671 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FGAP02671 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FGAP02671 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FGAP02671 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FGAP02671 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FGAP02671 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FGAP02671 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FGAP02671 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FGAP02671 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FGAP02671 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FGAP02671 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FGAP02671 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FGAP02671 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FGAP02671 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FGAP02671 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FGAP02671 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FGAP02671 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FGAP02671 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FGAP02671 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
FGAP02671 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FGAP02671 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
FGAP02671 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FGAP02671 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FGAP02671 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FGAP02671 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
FGAP02671 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
FGAP02671 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FGAP02671 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FGAP02671 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FGAP02671 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FGAP02671 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FGAP02671 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FGAP02671 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FGAP02671 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FGAP02671 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FGAP02671 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
FGAP02671 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FGAP02671 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FGAP02671 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FGAP02671 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FGAP02671 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FGAP02671 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FGAP02671 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FGAP02671 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FGAP02671 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FGAP02671 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FGAP02671 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FGAP02671 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FGAP02671 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FGAP02671 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FGAP02671 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FGAP02671 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FGAP02671 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FGAP02671 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FGAP02671 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FGAP02671 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FGAP02671 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
FGAP02671 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FGAP02671 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FGAP02671 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FGAP02671 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FGAP02671 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FGAP02671 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FGAP02671 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FGAP02671 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FGAP02671 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FGAP02671 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FGAP02671 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FGAP02671 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FGAP02671 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FGAP02671 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FGAP02671 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FGAP02671 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FGAP02671 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FGAP02671 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FGAP02671 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FGAP02671 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
FGAP02671 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FGAP02671 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FGAP02671 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FGAP02671 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms