Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOA1P02647 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOA1P02647 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOA1P02647 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOA1P02647 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOA1P02647 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOA1P02647 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
APOA1P02647 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOA1P02647 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOA1P02647 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOA1P02647 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOA1P02647 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOA1P02647 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOA1P02647 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOA1P02647 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOA1P02647 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOA1P02647 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOA1P02647 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOA1P02647 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOA1P02647 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOA1P02647 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
APOA1P02647 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOA1P02647 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOA1P02647 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOA1P02647 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOA1P02647 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOA1P02647 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOA1P02647 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOA1P02647 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOA1P02647 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOA1P02647 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOA1P02647 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOA1P02647 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOA1P02647 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOA1P02647 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOA1P02647 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOA1P02647 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOA1P02647 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOA1P02647 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOA1P02647 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOA1P02647 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOA1P02647 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOA1P02647 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
APOA1P02647 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOA1P02647 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
APOA1P02647 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOA1P02647 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOA1P02647 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOA1P02647 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOA1P02647 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOA1P02647 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOA1P02647 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOA1P02647 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOA1P02647 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOA1P02647 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOA1P02647 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOA1P02647 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOA1P02647 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOA1P02647 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOA1P02647 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOA1P02647 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOA1P02647 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOA1P02647 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
APOA1P02647 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOA1P02647 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOA1P02647 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOA1P02647 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
APOA1P02647 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOA1P02647 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOA1P02647 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOA1P02647 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOA1P02647 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOA1P02647 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOA1P02647 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOA1P02647 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOA1P02647 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOA1P02647 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOA1P02647 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOA1P02647 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOA1P02647 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOA1P02647 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOA1P02647 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOA1P02647 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOA1P02647 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOA1P02647 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOA1P02647 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
APOA1P02647 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOA1P02647 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOA1P02647 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOA1P02647 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOA1P02647 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOA1P02647 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOA1P02647 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOA1P02647 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOA1P02647 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOA1P02647 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOA1P02647 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOA1P02647 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOA1P02647 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
APOA1P02647 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms