Protein–RNA interactions for Protein: P01772

IGHV3-33, Immunoglobulin heavy variable 3-33, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-33P01772 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-33P01772 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-33P01772 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IGHV3-33P01772 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-33P01772 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-33P01772 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-33P01772 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-33P01772 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-33P01772 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-33P01772 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-33P01772 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-33P01772 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-33P01772 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-33P01772 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-33P01772 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-33P01772 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-33P01772 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-33P01772 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-33P01772 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-33P01772 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-33P01772 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-33P01772 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms