Protein–RNA interactions for Protein: P00488

F13A1, Coagulation factor XIII A chain, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13A1P00488 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
F13A1P00488 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
F13A1P00488 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
F13A1P00488 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
F13A1P00488 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
F13A1P00488 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
F13A1P00488 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
F13A1P00488 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
F13A1P00488 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
F13A1P00488 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
F13A1P00488 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
F13A1P00488 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
F13A1P00488 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
F13A1P00488 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
F13A1P00488 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
F13A1P00488 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
F13A1P00488 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
F13A1P00488 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
F13A1P00488 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
F13A1P00488 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
F13A1P00488 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
F13A1P00488 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
F13A1P00488 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
F13A1P00488 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
F13A1P00488 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
F13A1P00488 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
F13A1P00488 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
F13A1P00488 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
F13A1P00488 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
F13A1P00488 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
F13A1P00488 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
F13A1P00488 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
F13A1P00488 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
F13A1P00488 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
F13A1P00488 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
F13A1P00488 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
F13A1P00488 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
F13A1P00488 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
F13A1P00488 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
F13A1P00488 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
F13A1P00488 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
F13A1P00488 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
F13A1P00488 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
F13A1P00488 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
F13A1P00488 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
F13A1P00488 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
F13A1P00488 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
F13A1P00488 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
F13A1P00488 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
F13A1P00488 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
F13A1P00488 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
F13A1P00488 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
F13A1P00488 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
F13A1P00488 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
F13A1P00488 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
F13A1P00488 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
F13A1P00488 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
F13A1P00488 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
F13A1P00488 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
F13A1P00488 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
F13A1P00488 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
F13A1P00488 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
F13A1P00488 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
F13A1P00488 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
F13A1P00488 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
F13A1P00488 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
F13A1P00488 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
F13A1P00488 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
F13A1P00488 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
F13A1P00488 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
F13A1P00488 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
F13A1P00488 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
F13A1P00488 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
F13A1P00488 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
F13A1P00488 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
F13A1P00488 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
F13A1P00488 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
F13A1P00488 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
F13A1P00488 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
F13A1P00488 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
F13A1P00488 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
F13A1P00488 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
F13A1P00488 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
F13A1P00488 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
F13A1P00488 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
F13A1P00488 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
F13A1P00488 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
F13A1P00488 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
F13A1P00488 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
F13A1P00488 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
F13A1P00488 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
F13A1P00488 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
F13A1P00488 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
F13A1P00488 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
F13A1P00488 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
F13A1P00488 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
F13A1P00488 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
F13A1P00488 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
F13A1P00488 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
F13A1P00488 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms