Protein–RNA interactions for Protein: O96015

DNAL4, Dynein light chain 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAL4O96015 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DNAL4O96015 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms