Protein–RNA interactions for Protein: O95977

S1PR4, Sphingosine 1-phosphate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1PR4O95977 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
S1PR4O95977 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms