Protein–RNA interactions for Protein: O95803

NDST3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST3O95803 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDST3O95803 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDST3O95803 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDST3O95803 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDST3O95803 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDST3O95803 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDST3O95803 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDST3O95803 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDST3O95803 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDST3O95803 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDST3O95803 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDST3O95803 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDST3O95803 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDST3O95803 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDST3O95803 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDST3O95803 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDST3O95803 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NDST3O95803 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDST3O95803 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDST3O95803 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDST3O95803 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NDST3O95803 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NDST3O95803 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NDST3O95803 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NDST3O95803 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDST3O95803 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDST3O95803 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NDST3O95803 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDST3O95803 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDST3O95803 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDST3O95803 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDST3O95803 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDST3O95803 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDST3O95803 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDST3O95803 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDST3O95803 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NDST3O95803 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDST3O95803 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NDST3O95803 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NDST3O95803 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDST3O95803 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDST3O95803 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDST3O95803 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NDST3O95803 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDST3O95803 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDST3O95803 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDST3O95803 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDST3O95803 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDST3O95803 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDST3O95803 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDST3O95803 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDST3O95803 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDST3O95803 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDST3O95803 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDST3O95803 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDST3O95803 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDST3O95803 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDST3O95803 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDST3O95803 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDST3O95803 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDST3O95803 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDST3O95803 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDST3O95803 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDST3O95803 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDST3O95803 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDST3O95803 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NDST3O95803 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NDST3O95803 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDST3O95803 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDST3O95803 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDST3O95803 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDST3O95803 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDST3O95803 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDST3O95803 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDST3O95803 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDST3O95803 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDST3O95803 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDST3O95803 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDST3O95803 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDST3O95803 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NDST3O95803 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDST3O95803 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDST3O95803 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDST3O95803 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDST3O95803 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDST3O95803 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDST3O95803 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDST3O95803 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDST3O95803 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDST3O95803 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NDST3O95803 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDST3O95803 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDST3O95803 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDST3O95803 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDST3O95803 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDST3O95803 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDST3O95803 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDST3O95803 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDST3O95803 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDST3O95803 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms