Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA4FO95754 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA4FO95754 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA4FO95754 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA4FO95754 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA4FO95754 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA4FO95754 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA4FO95754 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA4FO95754 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA4FO95754 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA4FO95754 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA4FO95754 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA4FO95754 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA4FO95754 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA4FO95754 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA4FO95754 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA4FO95754 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA4FO95754 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA4FO95754 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA4FO95754 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA4FO95754 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA4FO95754 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA4FO95754 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA4FO95754 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA4FO95754 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA4FO95754 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA4FO95754 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA4FO95754 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA4FO95754 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA4FO95754 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA4FO95754 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA4FO95754 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA4FO95754 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA4FO95754 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA4FO95754 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA4FO95754 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA4FO95754 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA4FO95754 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA4FO95754 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA4FO95754 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA4FO95754 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA4FO95754 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA4FO95754 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA4FO95754 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms