Protein–RNA interactions for Protein: O95741

CPNE6, Copine-6, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE6O95741 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPNE6O95741 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPNE6O95741 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPNE6O95741 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPNE6O95741 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPNE6O95741 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPNE6O95741 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPNE6O95741 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPNE6O95741 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPNE6O95741 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPNE6O95741 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPNE6O95741 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPNE6O95741 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPNE6O95741 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPNE6O95741 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPNE6O95741 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPNE6O95741 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPNE6O95741 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPNE6O95741 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPNE6O95741 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPNE6O95741 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPNE6O95741 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CPNE6O95741 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPNE6O95741 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPNE6O95741 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPNE6O95741 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPNE6O95741 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPNE6O95741 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CPNE6O95741 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPNE6O95741 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPNE6O95741 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CPNE6O95741 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPNE6O95741 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPNE6O95741 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPNE6O95741 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPNE6O95741 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPNE6O95741 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPNE6O95741 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPNE6O95741 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPNE6O95741 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPNE6O95741 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPNE6O95741 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPNE6O95741 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPNE6O95741 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPNE6O95741 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CPNE6O95741 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms