Protein–RNA interactions for Protein: O95407

TNFRSF6B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF6BO95407 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNFRSF6BO95407 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNFRSF6BO95407 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNFRSF6BO95407 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNFRSF6BO95407 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNFRSF6BO95407 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNFRSF6BO95407 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNFRSF6BO95407 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNFRSF6BO95407 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNFRSF6BO95407 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TNFRSF6BO95407 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNFRSF6BO95407 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TNFRSF6BO95407 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF6BO95407 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF6BO95407 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF6BO95407 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF6BO95407 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF6BO95407 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF6BO95407 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF6BO95407 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF6BO95407 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF6BO95407 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF6BO95407 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF6BO95407 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF6BO95407 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF6BO95407 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF6BO95407 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF6BO95407 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFRSF6BO95407 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFRSF6BO95407 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFRSF6BO95407 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFRSF6BO95407 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFRSF6BO95407 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFRSF6BO95407 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFRSF6BO95407 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFRSF6BO95407 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFRSF6BO95407 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFRSF6BO95407 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFRSF6BO95407 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFRSF6BO95407 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFRSF6BO95407 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFRSF6BO95407 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFRSF6BO95407 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFRSF6BO95407 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFRSF6BO95407 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFRSF6BO95407 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms