Protein–RNA interactions for Protein: O95274

LYPD3, Ly6/PLAUR domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYPD3O95274 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms