Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPF6O94906 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRPF6O94906 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRPF6O94906 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRPF6O94906 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRPF6O94906 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF6O94906 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF6O94906 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF6O94906 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF6O94906 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF6O94906 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF6O94906 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF6O94906 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF6O94906 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF6O94906 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF6O94906 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF6O94906 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF6O94906 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF6O94906 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF6O94906 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF6O94906 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF6O94906 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF6O94906 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF6O94906 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF6O94906 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF6O94906 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF6O94906 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF6O94906 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF6O94906 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF6O94906 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF6O94906 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF6O94906 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms