Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG12O94817 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG12O94817 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG12O94817 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG12O94817 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG12O94817 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG12O94817 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG12O94817 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG12O94817 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG12O94817 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG12O94817 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG12O94817 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG12O94817 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG12O94817 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG12O94817 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG12O94817 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG12O94817 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG12O94817 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG12O94817 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG12O94817 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG12O94817 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG12O94817 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG12O94817 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG12O94817 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG12O94817 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG12O94817 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG12O94817 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG12O94817 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATG12O94817 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
ATG12O94817 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATG12O94817 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATG12O94817 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG12O94817 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG12O94817 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG12O94817 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG12O94817 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG12O94817 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG12O94817 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG12O94817 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG12O94817 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG12O94817 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG12O94817 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG12O94817 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG12O94817 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG12O94817 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG12O94817 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG12O94817 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG12O94817 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG12O94817 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG12O94817 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG12O94817 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG12O94817 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG12O94817 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG12O94817 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG12O94817 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG12O94817 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG12O94817 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG12O94817 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG12O94817 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG12O94817 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG12O94817 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG12O94817 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG12O94817 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG12O94817 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG12O94817 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG12O94817 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG12O94817 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG12O94817 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG12O94817 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG12O94817 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG12O94817 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG12O94817 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG12O94817 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG12O94817 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG12O94817 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG12O94817 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG12O94817 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG12O94817 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG12O94817 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG12O94817 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG12O94817 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG12O94817 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG12O94817 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG12O94817 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG12O94817 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG12O94817 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG12O94817 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG12O94817 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG12O94817 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG12O94817 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG12O94817 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG12O94817 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG12O94817 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG12O94817 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG12O94817 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG12O94817 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG12O94817 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG12O94817 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG12O94817 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG12O94817 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms