Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAPN15O75808 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAPN15O75808 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CAPN15O75808 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAPN15O75808 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAPN15O75808 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CAPN15O75808 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAPN15O75808 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAPN15O75808 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAPN15O75808 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAPN15O75808 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAPN15O75808 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAPN15O75808 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAPN15O75808 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAPN15O75808 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAPN15O75808 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAPN15O75808 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CAPN15O75808 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAPN15O75808 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAPN15O75808 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAPN15O75808 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAPN15O75808 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAPN15O75808 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAPN15O75808 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPN15O75808 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPN15O75808 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPN15O75808 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPN15O75808 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPN15O75808 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPN15O75808 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPN15O75808 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAPN15O75808 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAPN15O75808 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAPN15O75808 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAPN15O75808 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAPN15O75808 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAPN15O75808 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAPN15O75808 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAPN15O75808 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAPN15O75808 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAPN15O75808 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAPN15O75808 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAPN15O75808 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAPN15O75808 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CAPN15O75808 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPN15O75808 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPN15O75808 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPN15O75808 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPN15O75808 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPN15O75808 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPN15O75808 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPN15O75808 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPN15O75808 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPN15O75808 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms