Protein–RNA interactions for Protein: O75781

PALM, Paralemmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALMO75781 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PALMO75781 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PALMO75781 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PALMO75781 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PALMO75781 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PALMO75781 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PALMO75781 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALMO75781 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALMO75781 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALMO75781 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALMO75781 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALMO75781 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALMO75781 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PALMO75781 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PALMO75781 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PALMO75781 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PALMO75781 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PALMO75781 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PALMO75781 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PALMO75781 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PALMO75781 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PALMO75781 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PALMO75781 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PALMO75781 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PALMO75781 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PALMO75781 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PALMO75781 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PALMO75781 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PALMO75781 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PALMO75781 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PALMO75781 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PALMO75781 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PALMO75781 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PALMO75781 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PALMO75781 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PALMO75781 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PALMO75781 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PALMO75781 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PALMO75781 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PALMO75781 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PALMO75781 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PALMO75781 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PALMO75781 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PALMO75781 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PALMO75781 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PALMO75781 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PALMO75781 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PALMO75781 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PALMO75781 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PALMO75781 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PALMO75781 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PALMO75781 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PALMO75781 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PALMO75781 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PALMO75781 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PALMO75781 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PALMO75781 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PALMO75781 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PALMO75781 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PALMO75781 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PALMO75781 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PALMO75781 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PALMO75781 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PALMO75781 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PALMO75781 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PALMO75781 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALMO75781 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALMO75781 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALMO75781 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALMO75781 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALMO75781 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALMO75781 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALMO75781 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALMO75781 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALMO75781 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALMO75781 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALMO75781 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALMO75781 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALMO75781 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALMO75781 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALMO75781 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALMO75781 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PALMO75781 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALMO75781 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALMO75781 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALMO75781 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PALMO75781 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALMO75781 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALMO75781 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALMO75781 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALMO75781 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALMO75781 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALMO75781 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALMO75781 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALMO75781 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALMO75781 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALMO75781 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALMO75781 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALMO75781 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALMO75781 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms