Protein–RNA interactions for Protein: O75678

RFPL2, Ret finger protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL2O75678 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFPL2O75678 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RFPL2O75678 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFPL2O75678 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFPL2O75678 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFPL2O75678 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFPL2O75678 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFPL2O75678 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFPL2O75678 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFPL2O75678 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RFPL2O75678 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFPL2O75678 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFPL2O75678 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFPL2O75678 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RFPL2O75678 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFPL2O75678 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RFPL2O75678 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFPL2O75678 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFPL2O75678 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RFPL2O75678 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RFPL2O75678 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFPL2O75678 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFPL2O75678 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFPL2O75678 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFPL2O75678 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFPL2O75678 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFPL2O75678 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFPL2O75678 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFPL2O75678 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFPL2O75678 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFPL2O75678 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFPL2O75678 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFPL2O75678 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFPL2O75678 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFPL2O75678 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFPL2O75678 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFPL2O75678 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFPL2O75678 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFPL2O75678 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFPL2O75678 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFPL2O75678 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFPL2O75678 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms