Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPM3O75607 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPM3O75607 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPM3O75607 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPM3O75607 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPM3O75607 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPM3O75607 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPM3O75607 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPM3O75607 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NPM3O75607 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPM3O75607 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPM3O75607 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPM3O75607 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPM3O75607 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPM3O75607 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPM3O75607 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPM3O75607 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPM3O75607 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPM3O75607 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPM3O75607 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NPM3O75607 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NPM3O75607 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NPM3O75607 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPM3O75607 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPM3O75607 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPM3O75607 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPM3O75607 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPM3O75607 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPM3O75607 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPM3O75607 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NPM3O75607 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPM3O75607 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPM3O75607 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPM3O75607 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPM3O75607 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPM3O75607 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPM3O75607 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NPM3O75607 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPM3O75607 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPM3O75607 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NPM3O75607 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPM3O75607 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPM3O75607 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPM3O75607 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPM3O75607 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPM3O75607 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPM3O75607 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPM3O75607 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPM3O75607 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPM3O75607 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPM3O75607 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPM3O75607 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPM3O75607 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPM3O75607 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPM3O75607 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NPM3O75607 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPM3O75607 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPM3O75607 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPM3O75607 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPM3O75607 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPM3O75607 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPM3O75607 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPM3O75607 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NPM3O75607 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NPM3O75607 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NPM3O75607 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NPM3O75607 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NPM3O75607 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NPM3O75607 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NPM3O75607 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NPM3O75607 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NPM3O75607 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPM3O75607 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPM3O75607 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPM3O75607 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPM3O75607 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPM3O75607 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NPM3O75607 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPM3O75607 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPM3O75607 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPM3O75607 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPM3O75607 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPM3O75607 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPM3O75607 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NPM3O75607 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPM3O75607 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPM3O75607 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPM3O75607 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPM3O75607 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPM3O75607 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPM3O75607 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPM3O75607 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPM3O75607 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPM3O75607 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPM3O75607 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPM3O75607 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NPM3O75607 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NPM3O75607 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NPM3O75607 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NPM3O75607 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms