Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA10O75578 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms