Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F6O75461 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F6O75461 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F6O75461 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F6O75461 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F6O75461 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F6O75461 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F6O75461 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F6O75461 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F6O75461 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F6O75461 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F6O75461 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F6O75461 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F6O75461 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F6O75461 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F6O75461 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F6O75461 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F6O75461 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F6O75461 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F6O75461 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F6O75461 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F6O75461 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F6O75461 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F6O75461 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F6O75461 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F6O75461 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F6O75461 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F6O75461 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F6O75461 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F6O75461 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F6O75461 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F6O75461 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F6O75461 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F6O75461 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F6O75461 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F6O75461 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F6O75461 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F6O75461 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F6O75461 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F6O75461 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F6O75461 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F6O75461 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F6O75461 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F6O75461 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F6O75461 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F6O75461 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F6O75461 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F6O75461 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F6O75461 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F6O75461 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F6O75461 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F6O75461 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F6O75461 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F6O75461 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F6O75461 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F6O75461 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F6O75461 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F6O75461 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F6O75461 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F6O75461 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F6O75461 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F6O75461 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F6O75461 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F6O75461 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F6O75461 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F6O75461 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F6O75461 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F6O75461 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F6O75461 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F6O75461 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F6O75461 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
E2F6O75461 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
E2F6O75461 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
E2F6O75461 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
E2F6O75461 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F6O75461 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F6O75461 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F6O75461 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F6O75461 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F6O75461 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F6O75461 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F6O75461 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F6O75461 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F6O75461 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F6O75461 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F6O75461 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F6O75461 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F6O75461 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F6O75461 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F6O75461 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F6O75461 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F6O75461 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F6O75461 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F6O75461 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F6O75461 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F6O75461 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F6O75461 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F6O75461 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F6O75461 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F6O75461 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms