Protein–RNA interactions for Protein: O75449

KATNA1, Katanin p60 ATPase-containing subunit A1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNA1O75449 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KATNA1O75449 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms