Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPFIA2O75334 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPFIA2O75334 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIA2O75334 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIA2O75334 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIA2O75334 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIA2O75334 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIA2O75334 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIA2O75334 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIA2O75334 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIA2O75334 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA2O75334 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA2O75334 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA2O75334 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA2O75334 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA2O75334 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA2O75334 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA2O75334 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA2O75334 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA2O75334 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA2O75334 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIA2O75334 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIA2O75334 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIA2O75334 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIA2O75334 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIA2O75334 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPFIA2O75334 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPFIA2O75334 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPFIA2O75334 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPFIA2O75334 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIA2O75334 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.02■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms