Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RAB11FIP3O75154 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RAB11FIP3O75154 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RAB11FIP3O75154 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RAB11FIP3O75154 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RAB11FIP3O75154 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RAB11FIP3O75154 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RAB11FIP3O75154 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RAB11FIP3O75154 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RAB11FIP3O75154 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
RAB11FIP3O75154 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RAB11FIP3O75154 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RAB11FIP3O75154 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
RAB11FIP3O75154 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RAB11FIP3O75154 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAB11FIP3O75154 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAB11FIP3O75154 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAB11FIP3O75154 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
RAB11FIP3O75154 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAB11FIP3O75154 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAB11FIP3O75154 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAB11FIP3O75154 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAB11FIP3O75154 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAB11FIP3O75154 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAB11FIP3O75154 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAB11FIP3O75154 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAB11FIP3O75154 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RAB11FIP3O75154 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
RAB11FIP3O75154 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RAB11FIP3O75154 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RAB11FIP3O75154 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RAB11FIP3O75154 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RAB11FIP3O75154 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RAB11FIP3O75154 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAB11FIP3O75154 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAB11FIP3O75154 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAB11FIP3O75154 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAB11FIP3O75154 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAB11FIP3O75154 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAB11FIP3O75154 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAB11FIP3O75154 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAB11FIP3O75154 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RAB11FIP3O75154 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAB11FIP3O75154 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAB11FIP3O75154 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAB11FIP3O75154 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAB11FIP3O75154 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAB11FIP3O75154 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAB11FIP3O75154 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAB11FIP3O75154 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAB11FIP3O75154 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAB11FIP3O75154 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAB11FIP3O75154 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAB11FIP3O75154 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAB11FIP3O75154 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAB11FIP3O75154 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAB11FIP3O75154 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAB11FIP3O75154 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAB11FIP3O75154 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAB11FIP3O75154 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAB11FIP3O75154 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAB11FIP3O75154 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAB11FIP3O75154 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAB11FIP3O75154 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAB11FIP3O75154 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAB11FIP3O75154 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAB11FIP3O75154 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAB11FIP3O75154 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAB11FIP3O75154 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAB11FIP3O75154 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAB11FIP3O75154 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAB11FIP3O75154 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAB11FIP3O75154 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAB11FIP3O75154 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAB11FIP3O75154 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RAB11FIP3O75154 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAB11FIP3O75154 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms