Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN2BO60939 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN2BO60939 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN2BO60939 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN2BO60939 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN2BO60939 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCN2BO60939 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCN2BO60939 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN2BO60939 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN2BO60939 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCN2BO60939 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN2BO60939 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN2BO60939 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN2BO60939 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN2BO60939 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN2BO60939 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN2BO60939 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN2BO60939 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN2BO60939 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN2BO60939 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN2BO60939 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN2BO60939 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN2BO60939 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN2BO60939 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN2BO60939 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN2BO60939 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN2BO60939 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN2BO60939 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN2BO60939 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN2BO60939 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN2BO60939 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN2BO60939 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN2BO60939 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN2BO60939 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN2BO60939 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN2BO60939 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SCN2BO60939 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms