Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSVO60911 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSVO60911 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSVO60911 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSVO60911 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSVO60911 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSVO60911 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSVO60911 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSVO60911 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSVO60911 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSVO60911 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSVO60911 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSVO60911 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSVO60911 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSVO60911 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSVO60911 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSVO60911 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSVO60911 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSVO60911 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSVO60911 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSVO60911 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSVO60911 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSVO60911 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSVO60911 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSVO60911 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSVO60911 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSVO60911 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSVO60911 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSVO60911 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSVO60911 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSVO60911 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSVO60911 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSVO60911 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSVO60911 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSVO60911 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSVO60911 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
CTSVO60911 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSVO60911 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSVO60911 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSVO60911 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSVO60911 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSVO60911 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSVO60911 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSVO60911 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSVO60911 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSVO60911 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSVO60911 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSVO60911 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSVO60911 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSVO60911 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSVO60911 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSVO60911 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSVO60911 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSVO60911 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSVO60911 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSVO60911 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSVO60911 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSVO60911 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSVO60911 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSVO60911 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSVO60911 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSVO60911 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSVO60911 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSVO60911 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSVO60911 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSVO60911 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSVO60911 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSVO60911 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSVO60911 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSVO60911 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSVO60911 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSVO60911 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSVO60911 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSVO60911 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSVO60911 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSVO60911 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSVO60911 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSVO60911 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSVO60911 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSVO60911 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSVO60911 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSVO60911 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTSVO60911 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTSVO60911 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CTSVO60911 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSVO60911 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSVO60911 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSVO60911 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSVO60911 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSVO60911 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSVO60911 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSVO60911 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSVO60911 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSVO60911 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSVO60911 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSVO60911 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSVO60911 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSVO60911 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSVO60911 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSVO60911 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms