Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GMDSO60547 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GMDSO60547 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GMDSO60547 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GMDSO60547 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GMDSO60547 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GMDSO60547 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GMDSO60547 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GMDSO60547 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GMDSO60547 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GMDSO60547 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GMDSO60547 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GMDSO60547 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GMDSO60547 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GMDSO60547 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GMDSO60547 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GMDSO60547 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GMDSO60547 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GMDSO60547 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GMDSO60547 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GMDSO60547 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GMDSO60547 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GMDSO60547 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GMDSO60547 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GMDSO60547 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GMDSO60547 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GMDSO60547 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GMDSO60547 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GMDSO60547 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GMDSO60547 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GMDSO60547 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GMDSO60547 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GMDSO60547 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GMDSO60547 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GMDSO60547 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GMDSO60547 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GMDSO60547 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GMDSO60547 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GMDSO60547 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GMDSO60547 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GMDSO60547 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GMDSO60547 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GMDSO60547 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GMDSO60547 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GMDSO60547 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GMDSO60547 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GMDSO60547 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GMDSO60547 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GMDSO60547 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GMDSO60547 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GMDSO60547 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GMDSO60547 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GMDSO60547 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GMDSO60547 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GMDSO60547 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GMDSO60547 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GMDSO60547 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GMDSO60547 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GMDSO60547 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GMDSO60547 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GMDSO60547 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GMDSO60547 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GMDSO60547 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GMDSO60547 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GMDSO60547 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GMDSO60547 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GMDSO60547 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GMDSO60547 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GMDSO60547 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GMDSO60547 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GMDSO60547 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GMDSO60547 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GMDSO60547 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GMDSO60547 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GMDSO60547 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GMDSO60547 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GMDSO60547 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GMDSO60547 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GMDSO60547 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GMDSO60547 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GMDSO60547 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GMDSO60547 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GMDSO60547 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GMDSO60547 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GMDSO60547 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GMDSO60547 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GMDSO60547 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GMDSO60547 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GMDSO60547 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GMDSO60547 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GMDSO60547 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GMDSO60547 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GMDSO60547 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GMDSO60547 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GMDSO60547 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GMDSO60547 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GMDSO60547 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GMDSO60547 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GMDSO60547 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GMDSO60547 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 207.4 ms