Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP8B3O60423 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP8B3O60423 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP8B3O60423 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP8B3O60423 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP8B3O60423 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP8B3O60423 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP8B3O60423 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP8B3O60423 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP8B3O60423 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP8B3O60423 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP8B3O60423 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP8B3O60423 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP8B3O60423 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP8B3O60423 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP8B3O60423 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP8B3O60423 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP8B3O60423 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP8B3O60423 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP8B3O60423 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP8B3O60423 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP8B3O60423 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP8B3O60423 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP8B3O60423 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP8B3O60423 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP8B3O60423 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP8B3O60423 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP8B3O60423 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP8B3O60423 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP8B3O60423 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP8B3O60423 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP8B3O60423 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP8B3O60423 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP8B3O60423 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP8B3O60423 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP8B3O60423 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP8B3O60423 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP8B3O60423 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP8B3O60423 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP8B3O60423 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP8B3O60423 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP8B3O60423 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP8B3O60423 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP8B3O60423 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP8B3O60423 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP8B3O60423 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP8B3O60423 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP8B3O60423 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP8B3O60423 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP8B3O60423 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP8B3O60423 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP8B3O60423 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms