Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NOBOXO60393 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms