Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EFNA2O43921 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EFNA2O43921 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EFNA2O43921 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFNA2O43921 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
EFNA2O43921 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFNA2O43921 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFNA2O43921 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
EFNA2O43921 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFNA2O43921 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFNA2O43921 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFNA2O43921 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFNA2O43921 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFNA2O43921 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFNA2O43921 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EFNA2O43921 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EFNA2O43921 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EFNA2O43921 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EFNA2O43921 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EFNA2O43921 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EFNA2O43921 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EFNA2O43921 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNA2O43921 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNA2O43921 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNA2O43921 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNA2O43921 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNA2O43921 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNA2O43921 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNA2O43921 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNA2O43921 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNA2O43921 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNA2O43921 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNA2O43921 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNA2O43921 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNA2O43921 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNA2O43921 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNA2O43921 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNA2O43921 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA2O43921 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA2O43921 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA2O43921 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA2O43921 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA2O43921 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA2O43921 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms