Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXTL3O43909 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXTL3O43909 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXTL3O43909 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXTL3O43909 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXTL3O43909 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXTL3O43909 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXTL3O43909 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
EXTL3O43909 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXTL3O43909 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXTL3O43909 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EXTL3O43909 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EXTL3O43909 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EXTL3O43909 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EXTL3O43909 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EXTL3O43909 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXTL3O43909 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXTL3O43909 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
EXTL3O43909 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXTL3O43909 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
EXTL3O43909 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXTL3O43909 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXTL3O43909 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXTL3O43909 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXTL3O43909 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXTL3O43909 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EXTL3O43909 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EXTL3O43909 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EXTL3O43909 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EXTL3O43909 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXTL3O43909 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXTL3O43909 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXTL3O43909 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXTL3O43909 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXTL3O43909 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXTL3O43909 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXTL3O43909 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXTL3O43909 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXTL3O43909 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXTL3O43909 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXTL3O43909 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EXTL3O43909 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EXTL3O43909 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
EXTL3O43909 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
EXTL3O43909 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms