Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EDIL3O43854 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EDIL3O43854 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EDIL3O43854 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EDIL3O43854 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EDIL3O43854 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDIL3O43854 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDIL3O43854 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDIL3O43854 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDIL3O43854 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDIL3O43854 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDIL3O43854 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDIL3O43854 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDIL3O43854 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EDIL3O43854 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
EDIL3O43854 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
EDIL3O43854 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EDIL3O43854 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EDIL3O43854 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EDIL3O43854 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EDIL3O43854 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
EDIL3O43854 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EDIL3O43854 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EDIL3O43854 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDIL3O43854 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDIL3O43854 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDIL3O43854 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDIL3O43854 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDIL3O43854 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDIL3O43854 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDIL3O43854 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDIL3O43854 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDIL3O43854 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDIL3O43854 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDIL3O43854 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDIL3O43854 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDIL3O43854 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDIL3O43854 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDIL3O43854 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDIL3O43854 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDIL3O43854 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDIL3O43854 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDIL3O43854 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDIL3O43854 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms